В 1858 католической общине Казани был выделен участок на Арском кладбище. Часовню построили в 1885 по инициативе курата костела каноника Фелициана Кохановского в стиле псевдоготики по проекту губернского архитектора Л.К. Хрщоновича, поляка по происхождению, активного прихожанина.
В часовне до 1923 совершались заупокойные службы. Позднее помещение использовали для хозяйственных нужд учреждения, ведавшие Арским кладбищем. В советское время утрачены многие детали отделки фасада, полностью изменены интерьеры, кроме того, часовню соединили со стоящим рядом склепом.
В 1996 администрация города передала часовню возобновленному в 1995 католическому приходу. В 1996–1997 произведены ремонт и оборудование храма, и с 1998 по 2012 на кладбище действовала католическая церковь Воздвижения Креста Господня. После завершения строительства и открытия большого римско-католического костела в Казани кладбищенская часовня не используется.
